Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrig2Q52KR2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrig2Q52KR2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig2Q52KR2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig2Q52KR2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig2Q52KR2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig2Q52KR2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig2Q52KR2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig2Q52KR2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrig2Q52KR2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrig2Q52KR2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms