Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Spire1Q52KF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spire1Q52KF3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms