Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc47Q505F5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms