Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10488Q4KL05 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10488Q4KL05 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10488Q4KL05 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10488Q4KL05 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10488Q4KL05 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10488Q4KL05 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm10488Q4KL05 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10488Q4KL05 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms