Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec4Q497M3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec4Q497M3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms