Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt35Q497I4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms