Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lrrc43Q3V0L5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrc43Q3V0L5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc43Q3V0L5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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