Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330034G19RikQ3UWX6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E330034G19RikQ3UWX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms