Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUF8

Ankrd34b, Ankyrin repeat domain-containing protein 34B, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34bQ3UUF8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd34bQ3UUF8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd34bQ3UUF8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms