Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chpf2Q3UU43 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chpf2Q3UU43 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms