Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTE2

Gm428, Predicted gene 428, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm428Q3UTE2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm428Q3UTE2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm428Q3UTE2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm428Q3UTE2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms