Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy4Q3UQI9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mindy4Q3UQI9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms