Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog7Q3UM29 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms