Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc61Q3UJV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc61Q3UJV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc61Q3UJV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc61Q3UJV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms