Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp19Q3UJD6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp19Q3UJD6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms