Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccser2Q3UHI0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccser2Q3UHI0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccser2Q3UHI0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccser2Q3UHI0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccser2Q3UHI0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccser2Q3UHI0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms