Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitpnm3Q3UHE1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitpnm3Q3UHE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitpnm3Q3UHE1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pitpnm3Q3UHE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pitpnm3Q3UHE1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pitpnm3Q3UHE1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms