Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3aQ3UFY4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms