Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Yipf3Q3UDR8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Yipf3Q3UDR8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms