Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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