Protein–RNA interactions for Protein: Q3U497

Cd300lb, CMRF35-like molecule 7, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lbQ3U497 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cd300lbQ3U497 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd300lbQ3U497 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lbQ3U497 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lbQ3U497 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lbQ3U497 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lbQ3U497 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lbQ3U497 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lbQ3U497 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms