Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a5Q3U1J0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a5Q3U1J0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms