Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Palb2Q3U0P1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms