Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tbc1d2bQ3U0J8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbc1d2bQ3U0J8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms