Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl4Q3TZA2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl4Q3TZA2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms