Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lrrc28Q3TX51 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc28Q3TX51 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms