Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxw18Q3TSA9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxw18Q3TSA9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms