Protein–RNA interactions for Protein: Q3TPQ7

AW146154, Expressed sequence AW146154, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW146154Q3TPQ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AW146154Q3TPQ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AW146154Q3TPQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AW146154Q3TPQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms