Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms