Protein–RNA interactions for Protein: Q14B48

Ccdc129, Coiled-coil domain-containing protein 129, mousemouse

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc129Q14B48 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
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Ccdc129Q14B48 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc129Q14B48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc129Q14B48 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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Ccdc129Q14B48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc129Q14B48 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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Ccdc129Q14B48 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc129Q14B48 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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Ccdc129Q14B48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc129Q14B48 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc129Q14B48 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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Ccdc129Q14B48 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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Ccdc129Q14B48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Ccdc129Q14B48 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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Ccdc129Q14B48 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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Ccdc129Q14B48 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc129Q14B48 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc129Q14B48 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms