Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf3ip1Q149C2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms