Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rtel1Q0VGM9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtel1Q0VGM9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms