Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc162pQ0VG85 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc162pQ0VG85 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc162pQ0VG85 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms