Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal1Q0VBP7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal1Q0VBP7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms