Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hif3aQ0VBL6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hif3aQ0VBL6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hif3aQ0VBL6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms