Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5cQ0V8T7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms