Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab42Q0PD08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms