Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc7a1Q09143 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc7a1Q09143 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc7a1Q09143 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms