Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q08AU9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q08AU9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q08AU9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q08AU9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q08AU9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q08AU9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q08AU9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q08AU9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q08AU9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q08AU9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q08AU9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q08AU9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q08AU9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q08AU9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q08AU9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q08AU9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q08AU9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q08AU9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q08AU9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q08AU9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q08AU9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q08AU9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q08AU9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q08AU9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q08AU9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q08AU9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q08AU9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q08AU9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q08AU9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q08AU9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q08AU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q08AU9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q08AU9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms