Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssrp1Q08943 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssrp1Q08943 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms