Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms