Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Siah1bQ06985 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Siah1bQ06985 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah1bQ06985 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms