Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcn1Q05186 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rcn1Q05186 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms