Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox13Q04891 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox13Q04891 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms