Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx2Q03358 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms