Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Shc1P98083 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shc1P98083 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shc1P98083 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shc1P98083 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shc1P98083 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shc1P98083 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shc1P98083 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shc1P98083 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms