Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IhhP97812 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IhhP97812 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IhhP97812 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IhhP97812 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IhhP97812 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IhhP97812 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IhhP97812 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IhhP97812 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IhhP97812 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IhhP97812 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IhhP97812 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IhhP97812 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IhhP97812 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IhhP97812 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IhhP97812 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IhhP97812 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IhhP97812 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IhhP97812 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IhhP97812 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IhhP97812 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IhhP97812 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IhhP97812 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IhhP97812 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IhhP97812 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IhhP97812 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IhhP97812 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IhhP97812 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IhhP97812 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IhhP97812 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IhhP97812 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IhhP97812 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IhhP97812 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IhhP97812 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IhhP97812 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IhhP97812 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IhhP97812 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IhhP97812 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IhhP97812 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IhhP97812 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IhhP97812 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IhhP97812 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IhhP97812 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IhhP97812 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IhhP97812 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IhhP97812 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IhhP97812 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IhhP97812 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IhhP97812 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IhhP97812 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IhhP97812 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IhhP97812 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IhhP97812 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IhhP97812 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IhhP97812 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IhhP97812 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IhhP97812 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IhhP97812 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IhhP97812 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IhhP97812 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IhhP97812 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IhhP97812 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IhhP97812 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IhhP97812 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IhhP97812 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IhhP97812 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IhhP97812 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IhhP97812 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IhhP97812 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IhhP97812 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IhhP97812 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IhhP97812 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IhhP97812 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IhhP97812 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms