Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx3-1P97436 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkx3-1P97436 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx3-1P97436 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms