Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3aP97351 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3aP97351 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rps3aP97351 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3aP97351 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3aP97351 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3aP97351 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3aP97351 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3aP97351 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3aP97351 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms