Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mesp1P97309 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms